St Hervormde Kerk Waterlandkerkje verzorgt de exploitatie van het gebouw. De kerk is eigendom van SOZK. St Hervormde Kerk Waterlandkerkje organiseert regelmatig concerten. In de zomer zijn er de 7 weken expositie's.
Daarnaast vinden er kerkdiensten plaats en is de kerk te huur voor tropuw plechjtigheid, rouw bijeenkomst, afscheidsbijeenkomt e.d. Maar de kerk kan ook gehuurd worden voor informele bijeenkomsten, cursussen, workshops e.d.
Naast de kerk lag er een grafsteen van Ds Was uit eind 19e eeuw en er is een grafsteen afkomstig van het kerkje wat tussen Waterlandkerkje en Waterland Oudeman lag. Deze grafstenen willen we een mooie plek geven in de kerk.